Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
KRTAP4-12Q9BQ66 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms