Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
COL19A1Q14993 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL19A1Q14993 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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