Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RESTQ13127 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
RESTQ13127 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RESTQ13127 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RESTQ13127 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RESTQ13127 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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