Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRHP20396 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRHP20396 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRHP20396 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRHP20396 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRHP20396 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRHP20396 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRHP20396 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRHP20396 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRHP20396 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRHP20396 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRHP20396 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRHP20396 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRHP20396 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRHP20396 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRHP20396 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRHP20396 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRHP20396 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRHP20396 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRHP20396 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRHP20396 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TRHP20396 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TRHP20396 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TRHP20396 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TRHP20396 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRHP20396 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms