Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SOBPA7XYQ1 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SOBPA7XYQ1 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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