Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRERF1Q96PN7 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRERF1Q96PN7 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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