Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD11P31277 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD11P31277 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.2 ms