Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SPG7Q9UQ90 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SPG7Q9UQ90 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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