Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
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