Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHSY3Q70JA7 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHSY3Q70JA7 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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