Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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GEN1Q17RS7 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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GEN1Q17RS7 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GEN1Q17RS7 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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