Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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PTPRNQ16849 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPRNQ16849 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPRNQ16849 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPRNQ16849 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRNQ16849 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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