Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KCNMB1Q16558 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KCNMB1Q16558 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KCNMB1Q16558 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KCNMB1Q16558 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KCNMB1Q16558 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KCNMB1Q16558 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KCNMB1Q16558 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KCNMB1Q16558 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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KCNMB1Q16558 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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KCNMB1Q16558 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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KCNMB1Q16558 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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KCNMB1Q16558 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNMB1Q16558 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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