Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXE3Q13461 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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FOXE3Q13461 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXE3Q13461 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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