Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MRPL49Q13405 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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