Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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PTPRNQ16849 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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PTPRNQ16849 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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PTPRNQ16849 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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PTPRNQ16849 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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PTPRNQ16849 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRNQ16849 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
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PTPRNQ16849 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPRNQ16849 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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