Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PGGT1BP53609 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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