Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HCN4Q9Y3Q4 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HCN4Q9Y3Q4 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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HCN4Q9Y3Q4 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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HCN4Q9Y3Q4 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HCN4Q9Y3Q4 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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