Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
EHD3Q9NZN3 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
EHD3Q9NZN3 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms