Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG4CQ96DT6 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ATG4CQ96DT6 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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ATG4CQ96DT6 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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ATG4CQ96DT6 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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ATG4CQ96DT6 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ATG4CQ96DT6 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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