Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAMB3Q13751 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAMB3Q13751 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms