Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMAD4Q13485 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SMAD4Q13485 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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