Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
AP3B2Q13367 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
AP3B2Q13367 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms