Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNB1Q02641 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CACNB1Q02641 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms