Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SOBPA7XYQ1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SOBPA7XYQ1 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SOBPA7XYQ1 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms