Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HDGFL3Q9Y3E1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms