Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms