Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHANK2Q9UPX8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHANK2Q9UPX8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms