Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM35Q9UPQ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms