Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms