Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSKSQ9UJT2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms