Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFDP1Q9UEE9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CFDP1Q9UEE9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.6 ms