Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLKQ9UBT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLKQ9UBT6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms