Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHRF1Q9P1Y6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHRF1Q9P1Y6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms