Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20BQ9P0W2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms