Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF12Q9NZN5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms