Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOR4AQ9NXH8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms