Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT57Q9NWB7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT57Q9NWB7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms