Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRP7BPQ9NSQ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP7BPQ9NSQ0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms