Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MEPEQ9NQ76 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms