Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A4GALTQ9NPC4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms