Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARFGAP3Q9NP61 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms