Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOPCQ9HD26 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOPCQ9HD26 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms