Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LNPKQ9C0E8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms