Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARXQ96QS3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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