Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms