Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRIG1Q96JA1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms