Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAX2Q96IS3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAX2Q96IS3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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