Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RERGQ96A58 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RERGQ96A58 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms