Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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PTPRUQ92729 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
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PTPRUQ92729 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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PTPRUQ92729 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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PTPRUQ92729 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRUQ92729 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
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